دانشگاه علوم پزشکی اصفهان در سال 1387 از سوی معاونت تحقیقات و فناوری وزارت بهداشت، درمان و آموزش پزشکی به عنوان یکی از مراکز مرجع جهت تأسیس آزمایشگاه‌های جامع تحقیقات منطقه‌ای در نظر گرفته شد و معاونت تحقیقات و فناوری دانشگاه علوم پزشکی اصفهان روند تأسیس و تجهیز این آزمایشگاه را با هدف تقویت زیرساخت‌های پژوهش و فناوری و تسهیل ارتباطات و تعاملات بین دانشکده‌ها و مراکز تحقیقاتی آغاز نمود تا با ایجاد بستری مناسب برای ارائه خدمات پژوهشی و دستگاهی در سطح تخصصی وخدمات آزمایشگاهی به محققین دانشگاهی و صنعتی فعالیت نماید.
آزمایشگاه جامع تحقیقات دانشگاه علوم پزشکی اصفهان با بهره مندی از نیروهای متخصص و 12 آزمایشگاه نوین و پیشرفته جهت ارائه خدمات به جامعه دانشگاهی و محققین، در سطوح ملی و بین المللی با تکیه بر دستگاه‌های نوین آزمایشگاهی فعالیت می‌نماید. ارتقا و توسعه خدمات آزمایشگاهی، همکاری با سایر دانشگاه‌ها، پژوهشکده‌ها، مراکز تحقیقاتی و صنعتی از جمله اهداف آزمایشگاه جامع تحقیقات دانشگاه علوم پزشکی اصفهان می‌باشد.