اتاق تمیز یا همان کلین روم، یک فضای محافظت شده برای جلوگیری از ورود آلودگی هاست و برای صنایع حساس مانند داروسازی، پزشکی یا مواد غذایی می توان از آن استفاده کرد. هم اکنون اتاق تمیز در آزمایشگاه جامع با فضا و امکانات مناسب فعال و آماده خدمت رسانی در زمینه های مختلف به پژوهشگران می باشد.